房屋买卖补充协议有效，补充协议应明确写明需要补充的内容，同时该协议需要明确主合同即房屋买卖合同正文内容，或者采用将主合同作为附件的形式，最后交由双方签字确认，署明日期。
一般来说房屋买卖合同的履行周期比较长，经常会遇到新的情况，比如遇到政策性调整，或者贷款审批延迟，导致无法按照主合同约定继续履行的，则需要双方本着平等协商，诚实信用原则进一步协商，除了最初约定的房屋买卖合同以外，还需要针对具体的情况签订补充协议。
补充协议和主合同具有同等法律效力。与主合同不一致的地方，一般以补充协议为准。房屋买卖补充协议是否有效，首先要看主合同是否有效。如果主合同无效，签订的房屋买卖补充协议也无效;如果主合同有效，补充协议的内容不违反法律、法规的强制性规定的，补充协议有效。
房屋买卖补充协议的内容有哪些1、《售楼书》的重要内容应作为补充协议的组成部分
购房人在购置商品房时，尤其是其购置期房的时候，往往是看了开发商印制的《售楼书》，才决定是否购买。售楼书中往往列明了该楼盘的特点、交通、规划设计、房型、配套、装饰、设备等情况。购房人认为《售楼书》是开发商的承诺，因此，一旦交付的房屋与《售楼书》不一致，大有上当受骗的感觉。实践中，这类争议不在少数。为了避免未来可能产生的纠纷，建议购房人将开发商在楼书中承诺的与其有关的重要内容写在补充协议中。
2、房屋质量的约定
房屋质量的问题，是购房人入住后与开发商最容易产生争议的地方。因此，在合同或补充协议中约定房屋质量的内容是十分重要的。购房人应当与开发商约定的内容包括：墙体平直的标准;防水的标准，即房屋顶棚无水渍、厨房及厕所防水良好、上下水管与地板结合处无漏水、渗水;表面裂缝的标准：即开发商承诺商品房内部无任何裂缝，保温层墙壁表面平整，瓷砖地板平整无松动、无爆裂、无间隙;管线安装与室内表面的平整标准：即开发商承诺不在商品房内通行任何公用管线，承诺任何管道的安装不影响房屋室内表面的平整。采用的建筑材料应达到国家强制性标准等。
3、商品房交付的约定
房屋交付时，履行的手续有：房屋入住通知;钥匙收条。开发商应向购房人提交的资料有：《建设工程竣工验收备案表》、《住宅质量保证书》、《住宅使用说明书》该两书内容不得低于《商品住宅实行质量保证书和住宅使用说明书制度的规定》、实测面积等。
