农村房屋户主和房产证有关系。农村户主是房产证上的产权人。农村房屋一户人只能拥有一处宅基地，房产证是对房屋持有的证明文件，房产证上的名字就是对房屋具有所有权的人，可以履行自己的权利，农村房屋一户人只能拥有一处宅基地，户主即是我们通常说的户籍上的一家之主，故农村户主和房产证有关系。
农村房产证的作用能证明房子是自己的，对房屋有占有、使用、收益和处分的权利，还可以进行抵押贷款，房屋转让。而且，现在实行的住房制度改革、旧城改造、房屋拆迁，以及民事纠纷中的分家产、继承、赠与，权属等，都需要房产证等资料来作为依据。比如，在拆迁的时候，农村房屋拆迁补偿分为地上建筑物补偿和宅基地赔偿。如果没有房屋产权证等资料的话，就不能确定有效面积的土地补偿，也就没有了最基本的保障。
到哪里办理农村房产证？到房屋所在地房管部门办理。农村办理房产证，首先需要满足一定的条件。由于农村建房的宅基地需要通过审批，因此，农村房屋房产证的办理不同于城市房屋的先买房后办证。而是需要先提出申请，通过审批后，才可以建房并领取房产证。
(一)、申请条件：本乡居民，只有一处住宅，户籍所在村是中心村(屯)，确实有建设房屋必要的农户。
(二)、提供资料：
1、本人户口本，身份证。
2、建房申请。
(三)、办理程序：
1、建房户向村委会提出建房申请。
2、村委会审核同意，签字盖章。
3、向乡建办提出申请。
4、乡建办工作人员实地踏看，同意建房。
5、到乡建办领取房屋建设申请表。
6、经乡建办签字同意。
7、乡主管领导签字盖章，核实同意。
8、交县规划建设局审批。
9、建房户领取产权证。
